凈化車間的主要目的就是控制空氣污染，無塵車間必須將空氣塵埃量降到最低甚至達到無塵效果，這就要求凈化空調要配備好的過濾系統。 而且過濾器的性能好壞，也關系到對生產車間塵埃和微生物控制的效果。 所以凈化空調空氣過濾器的品質要求比較高，無塵室需要配備三級過濾，分別為空氣處理機組配備的初級和中效過濾器，以及送風末端配置的高效過濾器。

無塵室最重要的功能是過濾空氣中的細菌和塵埃，嚴格把控空氣中粒子，凈化空氣質量使其到達潔凈標準。 凈化工程中空調系統首要特點是風量要足夠大，這樣才能保證無塵車間的潔凈度。 空調風量的大小，主要是根據換氣次數調定的。 一般來說單向流的無塵室，換氣次數比較多。

一般來說無塵車間空調系統都會使用不同等級的過濾器，主要分初級、中級和高級這三種。這三級過濾器阻力基本都是有 700-800 帕。因此無塵室一般會采用集中和回風這兩種方式。為了嚴格把控無塵室內正負壓的調節，無塵車間空調管道的阻力一般比較大。而要克服阻力因素，就必須讓空氣處理機組中的送風機壓頭要足夠高。

現代工業的高速發展，使得工業產品擁有體積小、高價值的特點，如果潔凈空調機出現故障，將帶來數于萬計的損失，特別是醫用無塵室中，如果在手術或者是產房過程中，如果空調機組出現故障，將帶來生命的安危，因此要求組合式空調機組擁有相當的穩定性和可靠性，要求空氣處理機組的每一個部件采購中應該采用擁有良好的品質管理的廠家的產品，如在機組內部應該選用有認證的高品質風機和高品質的電機，對過濾器的選用也要非常慎用，特別是高效過濾器，如果有一個小孔，就帶來無數的細菌，后果是無法想象的。 另外在空氣處理機組的生產和檢測也要嚴格按照國家的標準制造。

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