潔凈車間的物料凈化設計主要是對原材料、半成品、工具和設備在運輸、輸送過程中的清洗處理。材料通道和人員通道應分開設置。



清洗準備室清洗后如何繼續輸送物料，主要取決于產品生產工藝的要求，這直接影響到清洗準備室的選址。一般情況下，物料應通過氣密室進入潔凈室（區），氣密室通常與潔凈區相鄰或在潔凈區內。因此，潔凈生產區與氣閘室的室內空氣壓力應保持在合理的壓差。使凈化空氣從潔凈生產區流向制劑室。

. 一般情況下，兩扇門通常作為機械聯鎖開關使用，即一扇門關閉時，另一扇門可以打開；有的簡化為非聯鎖式，由用戶自行管理；在藥品生產廠，箱體內設有紫外線燈，對轉運物料進行消毒；另一扇門只有在一扇門關閉的情況下才能開啟，在頻繁切換或長時間開啟的情況下，箱內還設置了一些帶高效過濾器的氣簾。



在無菌潔凈室中，經常使用直通式滅菌設備來輸送物料。這些設備大多是電加熱或蒸汽加熱。設備的一端打開細菌區的門。進料后，加熱滅菌一段時間，然后打開另一端的門將材料從無菌室取出。



另外，在流通過程中，有些需要在潔凈的隔墻上開孔，使成品不斷地通過墻體輸出，使孔洞成為室內凈化的薄弱環節。一般的處理方法是增加室內正壓，或在河中孔上方設置氣幕裝置；輸送無菌室分裝瓶等小物品時，在保證室內正壓的前提下，可在孔的兩側設置輸送帶，且孔內配有紫外線燈。

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