植物根系分析系統是由托普云農研發生產的，該儀器可以按成方式不同，能夠分為對原位根系圖像的分析儀，以及對洗根后的根系圖像恩熙儀。一般都有要求可分根系的長度、直徑、面積、體積、根尖數、分叉數、根交叉數等。專業些的植物根系分析系統，還可分析植物根系的主側根拓撲形態關系、連接關系，以及根尖部位的色彩變化，以便進行根系形態和構造研究。最新的植物根系分析系統應具備大批量圖像的全自動分析特性，用戶可對自動分析結果進行局部的交互編輯修正，以確保數據的科學性。
    植物根系分析系統能進行根系的顏色分析，確定出根系存活數量，輸出不同顏色根系的直徑、長度、投影面積、表面積、體積；能進行根系的拓撲分析，自動確定根的連接數、關系角等，可單獨自動分析主根或任意一支側根的長度和分叉數等；自動分析根系分級伸展的等級分布情況，可達到5級側根的自動分析；可單獨顯示標記根系的任意直徑段相應各參數（分檔數、檔直徑范圍任意可改）；能用盒維數法自動測根系分形維數。
    植物根系分析系統可人工輔助修正：圖像可放大縮小和局部觀察，可實現鼠標區域選擇統計、對污染區的輔助裁剪或橡皮擦修正。統計效果監視：監視和修正植物對象分析的精度。自動雜質剔除：根據尺寸等方面的區別，進行自動雜質剔除。輔助測量功能：可數據導出：分析圖像、分布圖、結果數據可保存，分析結果輸出至Excel表，可輸出分析標記圖；尺寸標定：自帶標定功能，實現半自動的尺寸標定，XY向可分別標定修正；長度測量：具有跟隨放大鏡功能，通過鼠標拖動精確測量。
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