甲醇與氯不易發生反應，但易與其水溶液作用，*初生成二氯甲醚(CH2Cl)2O，因水的作用轉變成HCHO與HCl;吸入濃的甲醇蒸氣時，除了特有的癥狀酩酊、頭痛以外，常使視力模糊而眼痛。這些癥狀有的在數小時之后即能發生，重癥時，呈現眩暈、呼吸困難、胃痛、疝痛、便秘，有時還會有出血，需要數日才恢復。在這期間也能引起疲勞、不適，重癥時能出現發紺。不論急性、慢性都需要較長時間才能恢復。工作場所空氣中甲醇蒸氣*高容許濃度260mg/m3。
甲醇具有較強的清洗作用，汽油車在改裝甲醇燃料，使用初期時，會將原來附著在油箱壁上或沉積在油箱底部的鐵銹、膠質顆粒、油污等雜志清洗下來 ，漂浮或混入燃料中。這些雜質，在汽油泵長期運轉下會被帶入油路中。極易造成油管路，濾清器，噴油嘴的堵塞。因此，在甲醇汽車改裝前，應先徹底的清洗一下汽車的燃油系統。